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真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標(biāo)準(zhǔn)文庫國產(chǎn)化解決方案
時間：
2025-04-23
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測序數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)異，關(guān)鍵指標(biāo)表現(xiàn)突出：

基礎(chǔ)數(shù)據(jù)優(yōu)秀：Raw Q30＞91%、Mapped rate＞99.4%、Adapter-Adapter＜0.003%

核心指標(biāo)穩(wěn)定：臺間Peak count 和 FRiP 均表現(xiàn)出良好的穩(wěn)定性和一致性


ATAC-seq和CUT&Tag作為研究染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的前沿技術(shù)，可精準(zhǔn)解析染色質(zhì)可及性和蛋白-DNA互作。針對這兩類文庫常見多峰干擾的測序問題，真邁生物聯(lián)合翌圣生物推出國產(chǎn)解決方案，采用高性能建庫試劑和SURFSeq 5000測序平臺，在保證數(shù)據(jù)質(zhì)量的同時顯著降低成本，為非標(biāo)準(zhǔn)文庫測序提供了可靠選擇。


真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標(biāo)準(zhǔn)文庫國產(chǎn)化解決方案

圖1. 標(biāo)準(zhǔn)文庫-WGS（上圖）和非標(biāo)準(zhǔn)文庫-ATAC-seq（下左圖）/CUT&Tag（下右圖）峰圖表現(xiàn)



01 測試


真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標(biāo)準(zhǔn)文庫國產(chǎn)化解決方案


1、數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)異

  • Raw Q30均值達(dá)91%以上，且臺間重復(fù)穩(wěn)定

  • Adapter-Adapter rate低至0.003%，有效數(shù)據(jù)利用率極高

真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標(biāo)準(zhǔn)文庫國產(chǎn)化解決方案


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圖2.下機(jī)數(shù)據(jù)表現(xiàn)


2、Mapping 統(tǒng)計(jì)

  • Mapped rate均值達(dá)99.4%，其中ATAC-seq的mapped rate 遠(yuǎn)高于ENCODE數(shù)據(jù)庫標(biāo)準(zhǔn)的95%

  • 臺間Peak count、FRip 表現(xiàn)穩(wěn)定且一致

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真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標(biāo)準(zhǔn)文庫國產(chǎn)化解決方案

圖3.Mapping 比對分析



3、Peak 一致性分析

  • 信噪比高，且臺間Peak 一致性高

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圖4.臺間Peak 一致性分析

ATAC-seq核心指標(biāo)包括測序深度、TSS富集分?jǐn)?shù)、FRiP、IDR、比對率、Peak count、Duplicate Rate和文庫復(fù)雜度，核心指標(biāo)參數(shù)可參考ENCODE數(shù)據(jù)庫：https://www.encodeproject.org


02 產(chǎn)品訂購


真邁×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非標(biāo)準(zhǔn)文庫國產(chǎn)化解決方案


真邁生物與翌圣生物強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合，充分發(fā)揮雙方在酶制劑研發(fā)和測序平臺構(gòu)建領(lǐng)域的技術(shù)優(yōu)勢，共同打造覆蓋“原料-設(shè)備-應(yīng)用”全產(chǎn)業(yè)鏈的創(chuàng)新解決方案。通過構(gòu)建開放共享的行業(yè)生態(tài)系統(tǒng)，持續(xù)為全球科研和醫(yī)療機(jī)構(gòu)提供更精準(zhǔn)、更高效的測序整體解決方案。

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