近日，真邁生物和達普生物強強合作，聯(lián)合發(fā)布GenoLab M基因測序儀檢測臨床腫瘤單細胞轉(zhuǎn)錄組樣本的評測數(shù)據(jù)。
本次測評基于達普Galaxy星海單細胞測序建庫系統(tǒng)完成兩類臨床腫瘤單細胞的轉(zhuǎn)錄組文庫制備，制備好的文庫由達普生物分別在GenoLab M和NovaSeq 6000上進行測序，測序數(shù)據(jù)分析表明，GenoLab M 表現(xiàn)優(yōu)異，與對比平臺檢測出的單細胞UMI水平、細胞聚類、同基因表達量結(jié)果高度一致。
01 實驗方案
1. 測試用樣本：兩種不同腫瘤組織制備而成的單細胞懸濁液；
2. 單細胞建庫系統(tǒng)：文庫制備試劑：星海單細胞 3' 轉(zhuǎn)錄組測序建庫試劑盒（Galaxy Single Cell 3' mRNA Kit v1.0)；文庫制備平臺：星海單細胞建庫系統(tǒng)(Galaxy Single Cell ?Analysis System）；
3. 測試平臺：GenoLab M、NovaSeq 6000；
4. 測試實驗：使用達普生物星海單細胞建庫系統(tǒng)與3' 轉(zhuǎn)錄組測序建庫試劑盒對兩種不同腫瘤組織解離后得到單細胞懸濁液進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序文庫制備（下文簡稱S1、S2）。構(gòu)建好的文庫分別在GenoLab M、NovaSeq 6000測序平臺上進行測序。
02 測試結(jié)果
GenoLab M 測試結(jié)果與對比平臺一致性高
對GenoLab M和NovaSeq 6000測序數(shù)據(jù)進行分析，S1和S2樣本在兩平臺檢測細胞UMI水平、細胞聚類、同基因的表達量等結(jié)果高度一致（圖1~3）。
圖1 細胞UMI分析結(jié)果
（左：S1；右：S2）
●Single-cell clustering 對比
?S1：
?S2：
圖2 細胞聚類分析
●Barcode assignment 對比
? ? S1：
? ? S2：
圖3 同一cell barcode 的 UMI及基因數(shù)對比分析的表達量
03 產(chǎn)品介紹
達普Galaxy星海單細胞建庫系統(tǒng)
1）性能優(yōu)：可一次性完成數(shù)百至數(shù)萬個細胞的分離，基因檢測靈敏度高；
2）上樣活：1-4 通道，可靈活選擇樣本數(shù)及細胞數(shù)量，方便快捷；
3）兼容好：文庫兼容 GenoLab M 和 NovaSeq 6000?等測序平臺；
4）分析全：自主開發(fā)的StarScope 生信分析軟件可完成分析報告的輸出；
5）流程活：可接駁下游流程?，如單液滴分選。
04 總結(jié)
基于達普Galaxy星海單細胞建庫系統(tǒng)構(gòu)建兩類腫瘤單細胞轉(zhuǎn)錄組文庫在GenoLab M進行測序，數(shù)據(jù)分析結(jié)果表明細胞UMI水平、細胞聚類、同基因的表達量與對比平臺一致性高，能夠極佳地滿足科研以及臨床對于單細胞測序需求。
GenoLab M基因測序平臺與達普Galaxy星海單細胞建庫系統(tǒng)均為全流程自主研發(fā)的國產(chǎn)化平臺，利用雙方平臺靈活上樣、高性價比等優(yōu)勢，能大大縮短單細胞測序周期，全面提高效率并降低測序成本，為臨床應(yīng)用提供從單細胞到數(shù)據(jù)結(jié)果的全流程解決方案。同時助力單細胞多組學科研普及化和轉(zhuǎn)化單細胞多組學研究在臨床中的應(yīng)用。在未來，雙方將進一步深化合作，解決單細胞測序在臨床與醫(yī)學轉(zhuǎn)化中的“卡脖子”技術(shù)，為科研用戶及臨床工作者提供高質(zhì)量、高性價比的單細胞測序全流程解決方案。